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      1. 您現(xiàn)在的位置是:首頁 >要聞 > 2020-11-13 08:37:35 來源:

        新技術(shù)利用熒光和機器學(xué)習來快速掃描數(shù)千張圖像

        導(dǎo)讀 任何生物樣品(例如污垢,水或食物)都含有數(shù)十億細菌。只有少數(shù)對人類有害或致病。但是,很少的病原體可能意味著可靠供應(yīng)肉類或生菜與爆發(fā)食

        任何生物樣品(例如污垢,水或食物)都含有數(shù)十億細菌。只有少數(shù)對人類有害或致病。但是,很少的病原體可能意味著可靠供應(yīng)肉類或生菜與爆發(fā)食物中毒(或更嚴重的是大流行)之間的區(qū)別。

        國防部高級研究計劃局(DARPA)的目標之一是在致命的病原體襲來之前發(fā)現(xiàn)它們。該機構(gòu)是美國國防部的一部分,致力于開發(fā)新技術(shù)來幫助保護美國。

        幾年前,DARPA向研究界發(fā)起了“朋友或敵人”挑戰(zhàn),以查看它們是否可以從非常復(fù)雜的樣品中快速分離出病原體而又不影響樣品的基本功能或表型。太平洋西北國家實驗室(PNNL)是面臨挑戰(zhàn)的三個機構(gòu)之一,組建了一支多學(xué)科團隊,在土壤微生物學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué),生化合成和數(shù)據(jù)分析方面擁有科學(xué)專長。

        現(xiàn)在,在2019年開始的項目中途,該團隊正在完善他們?yōu)椴≡w發(fā)現(xiàn)開發(fā)的有前途的新方法。

        這種稱為OmniScreen的方法是一條端到端的管道,用于快速有效地區(qū)分微生物群落中的大量致病細胞。該系統(tǒng)可在幾天之內(nèi)提取,探測和篩選成千上萬的細胞以挑選出病原體。

        值得注意的是,OmniScreen還可以使樣本保持活動狀態(tài)。

        通常,在生物學(xué)研究中,將樣品冷凍,然后根據(jù)需要進行“固定”使用。固定溶液可以殺死細菌,或至少改變其原始表型??朔@一障礙對于PNNL為項目的下一階段獲得DARPA的批準至關(guān)重要。

        PNNL的生物醫(yī)學(xué)科學(xué)家,OmniScreen項目負責人貝基·赫斯說:“我們真的不確定它是否會起作用。我們在一開始發(fā)現(xiàn)的部分風險是細胞可能無法在探測中幸存下來。” “這是進入第二階段的標準之一,我們使之奏效。”